در آزمایشگاه علوم گیاهی دانشجویان به مطالعه و بررسی مورفولوژی و آناتومی اندامهای رویشی و زایشی گیاهان می پردازند. برای بررسی بافت های گیاهی نمونه ها با استفاده از تکنیک برش گیری دستی آماده شده و در زیر میکروسکوپ مشاهده می گردند. همچنین تعداد زیادی اسلاید آماده از تمامی بافت ها و اندام های گیاهی موجود می باشد که دانشجویان بعد از مشاهده نمونه های آماده شده توسط خودشان، ازاین اسلایدها جهت مطالعات دقیق تر بهره می گیرند. همچنین علاوه برمیکروسکوپ های معمولی دو چشمی، میکروسکوپ های پیشرفته مجهز به عکسبرداری نیز موجود می باشد. مهمترین تجهیزات این آزمایشگاه به شرح زیر است: